Perly-Certoux är ett schweiziskt fotbollslag från staden Perly-Certoux, nära gränsen till Frankrike. Laget grundades 1965 och spelar för närvarande i 2. Liga Interregional, den fjärde divisionen i det schweiziska ligasystemet. Perly-Certoux spelar sina hemmamatcher på Stade des Trois-Chênes i Perly-Certoux.