Batu Dua FC (Malaysia) är en malaysisk fotbollsklubb baserad i Jalan Ipoh, Kuala Lumpur. Klubben grundades 2012 och spelar för närvarande i Malaysia M3 League, den tredje nivån i det malaysiska fotbollssystemet.

Batu Dua FC ägs av Batu Dua Group, ett fastighetsutvecklingsföretag. Klubbens hemmaarena är Batu Dua Stadium, som har en kapacitet på 1 000 personer.

Klubbens huvudtränare är den tidigare malaysiske landslagsmannen Norhafiz Zamani Misbah. Klubbens lagkapten är försvararen Firdaus Saiyadi.

Batu Dua FC:s mest framgångsrika period var 2016, då de vann Malaysia FA Cup. Klubben representerade Malaysia i AFC Cup 2017, men slogs ut i gruppspelet.

Några av Batu Dua FC:s mest kända spelare är den malaysiske landslagsmannen Nor Azam Azih och den thailändske landslagsmannen Pokklaw Anan.