FC Zlin U21 är reservlaget till den tjeckiska fotbollsklubben FC Zlin. Laget spelar i den tjeckiska U21-ligan och har sitt säte i staden Zlín.

FC Zlins U21-lag grundades 2015 och har sedan dess spelat i den tjeckiska U21-ligan. Laget har ännu inte vunnit några större titlar, men har presterat bra i ligan och har varit ett topplag i flera säsonger.

Några av de mest kända spelarna som har spelat för FC Zlins U21-lag är Antonín Barák, Tomáš Holeš och David Pavelka. Dessa spelare har alla gått vidare till att spela för det tjeckiska landslaget och gjort bra ifrån sig på internationell nivå.

FC Zlins U21-lag är en viktig del av klubbens utvecklingsprogram och har som mål att fostra unga spelare till att bli framtida stjärnor för A-laget. Laget spelar sina hemmamatcher på Stadion Letná i Zlín.