SV Waidhofen/Thaya är en österrikisk fotbollsklubb från staden Waidhofen an der Thaya i delstaten Niederösterreich. Klubben grundades 1919 och spelar sina hemmamatcher på Sparkassen-Stadion.

SV Waidhofen/Thaya har spelat i den regionala tredjeligan i Österrike (Regionalliga Ost) sedan 2005. Klubbens största framgång kom 1993 när man vann den österrikiska cupen efter att ha besegrat Rapid Wien i finalen.

Några av klubbens mest kända spelare genom tiderna inkluderar den tidigare österrikiske landslagsspelaren Helmut Köglberger och den tidigare Salzburg-anfallaren Alexander Zickler.

SV Waidhofens hemmafärger är röda och vita medan bortalaget är blått och gult. Klubbens emblem pryds av en fotboll och klubbens motto är "Kampfgeist und Leidenschaft" (kampvilja och passion).