FC Ingolstadt 04 är en fotbollsförening i Ingolstadt, Bayern, Tyskland. Klubben grundades 2004 genom att man slog samman fotbollssektionerna i MTV Ingolstadt och ESV Ingolstadt, och spelar för närvarande i 2. Bundesliga. Laget har spelat två säsonger i Bundesliga men blev nedflyttade säsongen 2016/17.