St. Sebastian FC är en indisk fotbollsklubb baserad i Kannur, Kerala. Klubben grundades 1956 och spelar i Kerala Premier League, den högsta ligan i Kerala. St. Sebastian FC har vunnit Kerala Premier League fyra gånger, 2005, 2008, 2010 och 2019. Klubben har också vunnit Kerala State Inter-District Championship åtta gånger, 1976, 1978, 1980, 1985, 1989, 1991, 1993 och 2001. St. Sebastian FC har representerat Kerala i Federation Cup, Indias nationella cupturnering, vid flera tillfällen. Klubben har nått kvartsfinalen i Federation Cup tre gånger, 1992, 1993 och 2006.